Las salidas en barco se realizan desde Tarifa, Algeciras y La Línea, siendo las condiciones meteorológicas y del mar, los factores condicionantes para elegir el puerto de salida y el tipo de embarcación. Los barcos son tripulados por profesionales del mar, y las excursiones guiadas por especialistas en Cetáceos, que ayudan a los pasajeros a encontrar los animales y a interpretar su comportamiento.

Desde el comienzo de esta actividad, los Biólogos toman datos de los avistamientos, que sirven de base para estudios de poblaciones y para regulaciones que garanticen la sostenibilidad de la acción y la conservación del recurso.